國際人類蛋白質組計劃官方數(shù)據(jù)庫neXtProt亞洲分站正式建成
深圳2023年8月7日 /美通社/ -- 日前,國際人類蛋白質組計劃官方數(shù)據(jù)庫neXtProt亞洲分站(https://nextprot.cn/)由深圳承啟生物科技有限公司(下稱承啟生物)建設完成,提供全功能的公共服務。這標志著中國擁有全部的人類蛋白質組公共數(shù)據(jù),將極大地提升中國和其他亞洲國家利用人類蛋白質組計劃成果的便捷性,助力人類健康和疾病的研究。
國際人類蛋白質組計劃(Human Proteome Project)是人類基因組計劃之后的又一重大國際合作大科學計劃,旨在鑒定所有人類基因組編碼蛋白,繪制人體蛋白質圖譜,作為研究蛋白質分子功能、推進疾病的診斷和治療的重要資源。相比于人類基因組計劃時中國僅負責1%的測序工作,中國科學家在人類蛋白質組計劃中的參與程度有了質的飛躍。目前,中國科學家負責了人類三條染色體上的蛋白質研究,分別是1號染色體、8號染色體、20號染色體。2022年起,暨南大學教授、承啟生物首席科學家張弓博士被選為國際人類蛋白質組計劃的常委,是唯一來自亞洲的常委。
國際人類蛋白質組計劃所產(chǎn)生的人類蛋白質數(shù)據(jù)載于neXtProt數(shù)據(jù)庫(www.nextprot.org),是目前人類蛋白質組最權威的數(shù)據(jù)庫,由瑞士生物信息學研究院(Swiss Institute of Bioinformatics)建立和維護。隨著中國科學界對蛋白質組高質量資源的需求與日俱增,洲際訪問neXtProt數(shù)據(jù)庫常常遇到速度緩慢和卡死狀況。為此,承啟生物從2021年末起承建neXtProt數(shù)據(jù)庫的亞洲分站(https://nextprot.cn/)。但由于中國和歐洲的網(wǎng)絡環(huán)境差異巨大,承啟生物做了許多調(diào)整與更改,復刻了主站的全部內(nèi)容與結構,方便用戶的使用習慣。同時,兩個數(shù)據(jù)庫的內(nèi)容也會定期同步。亞洲分站的建設完成,將大大提升中國和其他亞洲國家利用這些高質量蛋白質數(shù)據(jù)的便捷程度,對人類蛋白質的研究、疾病機制研究和藥物開發(fā)起到顯著的推動作用。
承啟生物是HUPO(人類蛋白質組組織)的長期合作伙伴,在人類蛋白質組計劃中有很大的投入。承啟生物以高精度的大規(guī)模測序比對算法FANSe系列和翻譯組測序技術(含RNC-seq, Ribo-seq)享譽業(yè)界,并為人類蛋白質組計劃免費提供翻譯組測序服務。
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